工業(yè)恒溫機(jī)RCA的優(yōu)勢(shì):
(1)高靈敏度,RCA有很強(qiáng)的擴(kuò)增能力,線性RCA的效率可達(dá)到105倍,而指數(shù)RCA的效率可達(dá)到109倍,具有檢測(cè)單拷貝的潛力。
(2)高序列特異性,可以區(qū)分單一位點(diǎn)的不同模式
(3)擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)過(guò)磷酸化處理后可直接用來(lái)測(cè)序
(4)高通量,RCA可以在靶目標(biāo)上形成閉合的環(huán)狀序列,確保RCA產(chǎn)生的信號(hào)集中在一點(diǎn),從而實(shí)現(xiàn)原位擴(kuò)增和載片擴(kuò)增。
工業(yè)恒溫機(jī)RCA的不足:
(1)瑣式探針常接近100bp,合成費(fèi)用較高。
(2)信號(hào)檢測(cè)時(shí)存在背景干擾問(wèn)題
單引物等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(SPIA)
工業(yè)恒溫機(jī)SPIA的核心是一條混合引物及可以切割DNA/RNA雜合鏈中RNA部分的RNA酶,由3'端DNA部分和5'端RNA部分組成。在反應(yīng)過(guò)程中,RNaseH不斷降解引物區(qū)DNA/RNA雙鏈中的RNA部分,暴露出模板上與引物RNA部分結(jié)合的位點(diǎn),然后新引物結(jié)合上去進(jìn)行鏈置換合成,經(jīng)過(guò)RNA降解、新引物結(jié)合、鏈置換的循環(huán)過(guò)程,實(shí)現(xiàn)模板互補(bǔ)序列的快速擴(kuò)增。
依賴解旋酶 DNA等溫?cái)U(kuò)增技術(shù) (HDA)
依賴解旋酶 DNA 等溫?cái)U(kuò)增技術(shù) (HDA) 是美國(guó)NEB 公司于 2004 年發(fā)明的一種新型核酸等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)。該技術(shù)模擬體內(nèi) DNA 復(fù)制的自然過(guò)程,利用解旋酶在恒溫下解開(kāi) DNA 雙鏈,再由 DNA 單鏈結(jié)合蛋白穩(wěn)定已解開(kāi)的單鏈為引物提供模板,然后在 DNA 聚合酶的作用下合成互補(bǔ)的雙鏈,繼而不斷重復(fù)上述循環(huán)擴(kuò)增過(guò)程,工業(yè)恒溫機(jī)最終實(shí)現(xiàn)靶序列的指
www.zswld.com